索引

A

atoms (matlanticgrrm.grrmdata.EQ の属性) (matlanticgrrm.grrmdata.TS の属性)

atoms2log (matlanticgrrm.grrmdata のクラス)

C

calc_image_numbers (matlanticgrrm.neb のクラス)

connections (matlanticgrrm.grrmdata.TS の属性) copy() (matlanticgrrm.atomslist モジュール)

D

del_constraints() (matlanticgrrm.atomslist モジュール)

E

energies (matlanticgrrm.grrmdata.EQ の属性) (matlanticgrrm.grrmdata.TS の属性)

EQ (matlanticgrrm.grrmdata のクラス) eq (matlanticgrrm.grrmdata.GrrmData の属性)

F

frozen_chemical_symbols (matlanticgrrm.grrmdata.EQ の属性) (matlanticgrrm.grrmdata.TS の属性)

frozen_positions (matlanticgrrm.grrmdata.EQ の属性) (matlanticgrrm.grrmdata.TS の属性)

G

Geometries (matlanticgrrm.geometry.geometries のクラス) get_connections (matlanticgrrm.grrmdata のクラス) get_forces() (matlanticgrrm.atomslist モジュール) get_kinetic_energy() (matlanticgrrm.atomslist モジュール)

get_positions() (matlanticgrrm.atomslist モジュール) get_potential_energy() (matlanticgrrm.atomslist モジュール) get_total_energy() (matlanticgrrm.atomslist モジュール) GrrmData (matlanticgrrm.grrmdata のクラス)

L

ListBFGS (matlanticgrrm.optimize のクラス) ListBFGSLineSearch (matlanticgrrm.optimize のクラス) ListFIRE (matlanticgrrm.optimize のクラス) ListLBFGS (matlanticgrrm.optimize のクラス) ListLBFGSLineSearch (matlanticgrrm.optimize のクラス) ListNEB (matlanticgrrm.neb のクラス)

ListOptimizer (matlanticgrrm.optimize のクラス) ListSella (matlanticgrrm.optimize のクラス) ListVibrations (matlanticgrrm.vibrations のクラス) log2atoms (matlanticgrrm.grrmdata のクラス) lread (matlanticgrrm.io.formats のクラス) lwrite (matlanticgrrm.io.formats のクラス)

M

make_images (matlanticgrrm.neb のクラス) matlanticgrrm モジュール matlanticgrrm.atomslist モジュール, [1] matlanticgrrm.geometry.geometries モジュール matlanticgrrm.grrmdata モジュール, [1] matlanticgrrm.io.formats モジュール matlanticgrrm.log モジュール

matlanticgrrm.neb モジュール matlanticgrrm.optimize モジュール, [1] matlanticgrrm.vibrations モジュール matlanticgrrm.visualize モジュール move_chemical_symbols (matlanticgrrm.grrmdata.EQ の属性) (matlanticgrrm.grrmdata.TS の属性) move_positions (matlanticgrrm.grrmdata.EQ の属性) (matlanticgrrm.grrmdata.TS の属性)

N

neb_graphs (matlanticgrrm.neb のクラス)

P

PT (matlanticgrrm.grrmdata のクラス)

pt (matlanticgrrm.grrmdata.GrrmData の属性)

R

run() (matlanticgrrm.optimize.ListOptimizer のメソッド) (matlanticgrrm.optimize.ListSella のメソッド) (matlanticgrrm.vibrations.ListVibrations のメソッド)

S

same() (matlanticgrrm.geometry.geometries.Geometries のメソッド) set_calculator() (matlanticgrrm.atomslist モジュール) set_cell() (matlanticgrrm.atomslist モジュール)

set_constraints() (matlanticgrrm.atomslist モジュール) set_pbc() (matlanticgrrm.atomslist モジュール) similar() (matlanticgrrm.geometry.geometries.Geometries のメソッド) summary() (matlanticgrrm.vibrations.ListVibrations のメソッド)

T

traj2cif (matlanticgrrm.io.formats のクラス) traj2xyz (matlanticgrrm.io.formats のクラス)

translate() (matlanticgrrm.atomslist モジュール) TS (matlanticgrrm.grrmdata のクラス) ts (matlanticgrrm.grrmdata.GrrmData の属性)

V

vib_graphs() (matlanticgrrm.vibrations モジュール) view() (matlanticgrrm.visualize モジュール)

view_images() (matlanticgrrm.visualize モジュール) view_with_coordinate() (matlanticgrrm.visualize モジュール) view_with_index() (matlanticgrrm.visualize モジュール)

W

write_mode() (matlanticgrrm.vibrations.ListVibrations のメソッド)

モ

モジュール matlanticgrrm matlanticgrrm.atomslist, [1] matlanticgrrm.geometry.geometries matlanticgrrm.grrmdata, [1] matlanticgrrm.io.formats matlanticgrrm.log matlanticgrrm.neb matlanticgrrm.optimize, [1] matlanticgrrm.vibrations matlanticgrrm.visualize