########################### GRRMのデータのインポート ########################### .. module:: matlanticgrrm.grrmdata GrrmData クラス =============== .. autoclass:: matlanticgrrm.grrmdata.GrrmData log2atoms() =============== .. autoclass:: matlanticgrrm.grrmdata.log2atoms atoms2log() =============== .. autoclass:: matlanticgrrm.grrmdata.atoms2log get_connections() =================== .. autoclass:: matlanticgrrm.grrmdata.get_connections EQ クラス ========== .. autoclass:: matlanticgrrm.grrmdata.EQ .. attribute:: atoms ase.Atomsオブジェクトを要素とするリスト. .. attribute:: energies GRRMで計算されたエネルギー(eV) .. attribute:: move_chemical_symbols 動かす原子の元素のリスト .. attribute:: move_positions 動かす原子の座標 .. attribute:: frozen_chemical_symbols FrozenAtomsの元素のリスト .. attribute:: frozen_positions FrozenAtomsの座標 TS クラス ========== .. autoclass:: matlanticgrrm.grrmdata.TS .. attribute:: atoms ase.Atomsオブジェクトを要素とするリスト. .. attribute:: connections GRRMで計算されたCONNECTIONS .. attribute:: energies GRRMで計算されたエネルギー(eV) .. attribute:: move_chemical_symbols 動かす原子の元素のリスト .. attribute:: move_positions 動かす原子の座標 .. attribute:: frozen_chemical_symbols FrozenAtomsの元素のリスト .. attribute:: frozen_positions FrozenAtomsの座標 PT クラス ========== .. autoclass:: matlanticgrrm.grrmdata.PT :class:`TS` クラスと同じPoperty